窈娘尸身被打撈上來之后，這首詩也被發(fā)現(xiàn)。武承嗣見詩大怒，因?yàn)椴粌H是一個(gè)美女因此詩喪命，更重要的是，“意氣雄豪非分理，驕矜勢(shì)力橫相干”這兩句詩揭了他的老底。
于是，他很快就指使酷吏來俊臣給喬知之網(wǎng)羅重大罪名，下獄處死，并滅族。
武承嗣奪人所愛以致香消玉殞，本應(yīng)問心有愧羞慚無地，竟然因?yàn)榭嘀靼l(fā)發(fā)牢騷就如此瘋狂報(bào)復(fù)。
宋之問涉嫌因詩殺人，喬知之則是因詩被殺。
對(duì)喬知之之死，沈佺期很痛心，但面對(duì)如日中天的武承嗣，他又能如何呢？
在西晉，孫秀殺害石崇不過十幾天后，就在新一輪的權(quán)力角逐中被殺。
在大唐，武承嗣殺害喬知之的下一年也就死掉了。
為了爭(zhēng)做太子，武承嗣除殘酷迫害反對(duì)者外，對(duì)武則天及其寵臣極盡阿諛之能事。
長(zhǎng)壽二年（693年）九月，武承嗣率五千人上表，請(qǐng)加尊號(hào)“金輪圣神皇帝”；延載元年（694年）五月，武承嗣又率二萬六千余人，請(qǐng)加尊號(hào)“越古金輪芒神皇帝”。武承嗣等兩次請(qǐng)加尊號(hào)，武則天都接受了，并高興得大赦天下。
從垂拱元年（685年）至天冊(cè)萬歲元年（695年），武則天寵信薛懷義（即馮小寶），神功元年（697年）以后，武則天寵相張易之、張昌宗兄弟。武承嗣、武三思兄弟，對(duì)薛懷義“皆執(zhí)僮仆之禮以事之”，“懷義欲乘馬，承嗣、三思必為之執(zhí)轡”。對(duì)張易之、張昌宗兄弟，他們“爭(zhēng)為執(zhí)轡，謂易之為五郎，昌宗為六郎”。
武則天對(duì)武承嗣很信任，她覺得武承嗣等人的“自古天子未有以異姓為嗣者”，也有道理，所以在立子、立侄為太子問題上，長(zhǎng)期猶豫不決。可是，在朝廷大臣李昭德，狄仁杰、吉頊等人的不斷勸說下，武則天終于做出立子不立侄的最后決定。
圣歷元年（698年），武承嗣因?yàn)樽鎏拥幕孟霃氐灼茰纾瑧n憤而死。
酷吏來俊臣也沒好下場(chǎng)，比武承嗣死的還早一些。
他無賴出身，善于告密，得到武則天信任，先后任侍御史、御史中丞、太仆卿，組織數(shù)百名無賴專事告密，設(shè)立推事院，聯(lián)合黨羽朱南山等撰寫《羅織經(jīng)》，制造各種殘酷刑具，大興刑獄，采取刑訊逼供手段，任意捏造罪狀致人死地，大臣和李唐宗室遭到枉殺滅族者達(dá)數(shù)千家。
后來來俊臣竟企圖陷害武氏諸王、太平公主、張易之等武則天最親信的人物，誣告皇嗣李旦和廬陵王李顯謀反，遭到衛(wèi)遂忠告發(fā)。
萬歲通天二年（697年），武氏諸王與太平公主等乘機(jī)揭露來俊臣種種罪惡。武則天下令處死來俊臣，將其酷吏黨徒全部流放嶺南，延續(xù)十四年之久的恐怖“酷吏政治”宣告結(jié)束。
圣歷三年（699年），沈佺期被武則天選中修撰《三教珠英》，升職為正六品上的通事舍人，沈佺期的文學(xué)特征也開始有了些變化。
“彩樓大戰(zhàn)”，沈佺期只因自己的詩結(jié)尾不夠陽光，輸給了宋之問。然而，細(xì)品沈佺期詩集中的句子，其實(shí)比宋之問要強(qiáng)。
以刻板著稱的應(yīng)制詩，和蘇味道、李嶠他們相比，沈佺期的詩，讀起來也是有美不勝收之感，像《人日重宴大明宮賜彩縷人勝應(yīng)制》這首詩，其中“山鳥初來猶怯囀，林花未發(fā)已偷新”，語法就十分活潑，“偷新”兩字尤其生動(dòng)。后來《紅樓夢(mèng)》中林黛玉有“偷來梨蕊三分白”一句，這一“偷”字想必就是從沈佺期這里“偷”來的。
這一時(shí)期，武則天帶著二張和一群“珠英學(xué)士”們四處游玩，沈佺期也在其中，寫下了《從幸香山寺應(yīng)制》、《嵩山石淙侍宴應(yīng)制》等眾多應(yīng)制詩。
圣歷三年（700年）五月，武則天在嵩山石淙河這一景區(qū)建了座三陽宮，宴樂之余，她親自寫了一首《石淙》詩，于是李顯、李旦、武三思、狄仁杰、張易之、張昌宗、姚崇、李嶠、蘇味道、崔融等人紛紛應(yīng)和，沈佺期也位列其中，可見他當(dāng)時(shí)是何等受恩寵了。
沈佺期在《從幸香山寺應(yīng)制》中寫道：“南山奕奕通丹禁，北闕峨峨連翠云。嶺上樓臺(tái)十地起，城中鐘鼓四天聞。旃檀曉閣金輿度，鸚鵡晴林采眊分。愿以醍醐參圣酒，還將祇苑當(dāng)秋汾。”
因修書有功，一批官員被升職，沈佺期也于長(zhǎng)安二年（702年）被提升為從五品上的考功員外郎，負(fù)責(zé)貢舉。
在唐朝，考功員外郎主要從事科舉考試的一些事宜。唐朝科考一般是三年一舉行，沈佺期作為京官，非大比之年并不是很忙，公事之余他的主要工作仍然是侍從武皇，做詩應(yīng)對(duì)。
沈佺期隨武則天去過嵩山，去過龍門（今四川廣元）、七盤嶺（今陜西勉縣），瀛洲（今河北河間）等地，分別有詩《過蜀龍門》、《夜宿七盤嶺》、《登瀛洲城南樓寄遠(yuǎn)》。
隨后，沈佺期由考功郎晉升為給事中，然后做了尚書。沈佺期在給事中任上三年，尚書任上五年。他在《自考功員外授給事中》詩中記錄了自己的升遷之路：
“南省推丹地，東曹拜瑣闈。
惠移雙管筆，恩降五時(shí)衣。
出入宜真選，遭逢每濫飛。
器慚公理拙，才謝子云微。
案牘遺常禮，朋僚隔等威。
上臺(tái)行揖讓，中禁動(dòng)光輝。
旭日千門起，初春八舍歸。
贈(zèng)蘭聞宿昔，談樹隱芳菲。
何幸鹽梅處，唯憂對(duì)問機(jī)。
省躬知任重，寧止冒榮非。”
武則天的五言詩做得很好，書法也很有名氣，她的飛白為古今一絕，所以她對(duì)才人也格外看重，沈佺期也是她當(dāng)時(shí)看重的俊才之一。
“南省推丹地，東曹拜瑣闈”，就是當(dāng)時(shí)詳細(xì)的描述。
“惠移雙管筆，恩降五時(shí)衣。出入宜真選，遭逢每濫飛”，這四句說明了沈佺期當(dāng)時(shí)所受到的恩遇以及因得寵而遭到同僚的妒忌與中傷。
“案牘遺常禮，朋僚隔等威。上臺(tái)行揖讓，中禁動(dòng)光輝。”此詩句恰如其分地描述了給事中這個(gè)官職在中書省的地位與威風(fēng)。
給事中為同三品，具體負(fù)責(zé)中書省的日常政務(wù)工作。尚書在唐時(shí)一般由正三品以上官員充任，位列九卿，完全可以用“顯赫”形容。
沈佺期在《移禁司刑》詩中說：“寵邁乘軒鶴，榮過食稻鳧。何功游畫省，何德理黃樞。”這是他在做尚書時(shí)享受的待遇。