臺灣南部登陸，攻克荷蘭殖民者的巢穴赤嵌城(今安平)。次年，荷蘭總督投降，鄭氏占領(lǐng)臺灣。
    康熙二年（1663年癸卯）
    五月詔天下錢糧統(tǒng)歸戶部，部寺應(yīng)用，俱向戶部領(lǐng)取，著為令。為慈和皇太后上尊謚孝康熙慈和莊懿恭惠崇天育圣皇后。奉移世祖梓宮往孝陵，奉安地宮。
    康熙三年（1664年甲辰）
    四月鰲拜奏內(nèi)大臣費揚古之子侍衛(wèi)倭赫擅騎御馬，費揚古怨，被籍家棄市。詔令工部織染局歸內(nèi)務(wù)府。
    康熙四年（1665年乙巳）
    九月冊立輔臣索尼之孫女赫舍里氏為皇后。
    十月康熙帝首至南苑校射行圍。
    康熙五年（1666年丙午）
    十二月鰲拜矯旨殺蘇納海、朱昌祚、王登連。
    康熙六年（1667年丁未）
    正月封世祖第二子皇兄福全為裕親王。
    六月，索尼病死。
    七月，康熙親政。
    九月命修《世祖實錄》。康親王杰書議蘇克薩哈罪。十一月冬至，祀天于圜丘，奉世祖章皇帝配享。
    康熙十年（1671年辛亥）
    正月封世祖第五子常寧為恭親王。
    二月命編纂《孝經(jīng)衍義》。
    康熙十一年（1672年壬子）
    二月康熙帝至先農(nóng)壇首次行耕耤禮。朝日于東郊。
    愛新覺羅·胤禔（1672-1734年）出生，是為皇長子
    康熙十二年（1673年癸丑）
    正月幸南苑，大閱八旗將士。此后或行大閱于盧溝橋，或玉泉山，或多倫諾爾；地?zé)o一定，時間亦不以三年為限。三藩之亂爆發(fā)。
    再次禁止虐待奴仆和殉
    準(zhǔn)格爾部內(nèi)亂
    康熙十三年（1674年甲寅）
    五月皇次子胤礽生，皇后崩于坤寧宮，謚號“仁孝皇后”
    十二月康熙帝擬前往親征三藩叛亂，王大臣以京師為根本重地，且太皇太后年事已高，力諫乃止。提督王輔臣陜西策應(yīng)三藩叛亂，殺經(jīng)略莫洛。
    愛新覺羅胤礽（嫡長子，皇次子）出世
    康熙十四年（1675年乙卯）
    康熙出巡圖
    四月以上諭確立經(jīng)筵的形式為侍臣進講，然后皇帝復(fù)講，互相討論以達到對經(jīng)義有所闡發(fā)。
    十二月冊嫡子胤礽為皇太子，詔告天下
    康熙十五年（1676年丙辰）
    正月以建儲上太皇太后、皇太后徽號。因軍需浩繁，民力唯艱，暫停仁孝皇后陵寢建造之工。
    十月康熙帝命講官進講《通鑒》。耿精忠勢窮而降，三藩叛域浙、閩、陜漸次平定。
    康熙十六年（1677年丁巳）
    二月幸南苑行圍。大閱于南苑，命內(nèi)大臣、大學(xué)士、學(xué)士諸文臣亦俱披甲。
    皇三子愛新覺羅·胤祉出生
    康熙十七年（1678年戊午）
    正月詔中外臣工各舉博學(xué)通才之，以備顧問，由皇帝親試。大學(xué)士李霨等舉薦曹溶等71，命赴京齊集請旨。
    二月制《四書講疏義序》。皇后鈕祜祿氏崩于坤寧宮，輟朝五日，謚曰孝昭皇
    后。
    十月三十皇四子胤禛出世即雍正皇帝
    康熙十八年（1679年己未）
    正月平定三藩之亂已取得階段性勝利，康熙帝御午門宣捷。
    □授予噶爾丹博碩克圖汗稱號
    康熙十九年（1680年庚申）
    四月以學(xué)士張英等供奉內(nèi)廷，日備顧問，下部優(yōu)恤，高士奇、杜訥均授翰林官。命南書房翰林每日晚講《通鑒》。宗府進《玉牒》。設(shè)武英殿造辦處。諭：凡放匠之處，妃、嬪、貴等不許行走，待晚間放匠后方許行走。
    康熙二十年（1681年辛酉）
    正月增置講官。
    平定三藩之亂
    愛新覺羅·胤禩(1681-1726)清康熙帝第八子生
    康熙二十一年（1682年壬戌）
    正月上元節(jié)，賜群臣宴，觀燈，用柏梁體賦詩。上為制《升平嘉宴詩序》，刊石于翰林院。
    康熙二十二年（1683年癸亥）
    二月康熙帝初次幸五臺山。
    五月設(shè)漢軍火器營。
    愛新覺羅·胤禟（1683-1726），清康熙帝的第九子生。愛新覺羅·胤礻，清康熙帝第十子生。
    康熙二十三年（1684年甲子）
    正月命整肅朝會禮儀。首次纂修《大清會典》，自崇德元年至康熙二十五年。
    二月以薩克素兵臨雅克薩。
    四月諭講官，講章以精明晰為尚，毋取繁衍。
    政治
    立儲緣由
    1前朝歷史教訓(xùn)
    康熙帝的曾祖父努爾哈赤、祖父皇太極臨死之前都沒有公開確定并宣布皇位繼承，努爾哈赤死后由八旗旗主公推新汗，皇太極死后由實力較強的諸王、大臣議立新君。由此引起爭奪大位的事件，幾乎兵戎相見，使政權(quán)瀕于分裂的危險。
    2皇族旗權(quán)矛盾
    皇權(quán)是指皇帝的權(quán)力，旗權(quán)是指八旗貴族的權(quán)力，二者有統(tǒng)一、也有矛盾。天命末、崇德末的皇位繼承，旗權(quán)占主導(dǎo)地位。順治朝由諸王、大臣議立新君的制度開始發(fā)生變化。順治帝24歲病逝前，想不遵祖制，以從兄弟為繼承。但他的愿望沒有實現(xiàn)。最后由順治帝與孝莊太后、諸王、大臣等商量，決定由皇三子玄燁來繼承皇位，四大臣索尼（正黃旗）、蘇克薩哈（正白旗）、遏必隆（鑲藍旗）、鰲拜（鑲黃旗）輔政，皇權(quán)與旗權(quán)取得了折衷。康熙帝立皇太子，為的是強化皇權(quán)，削弱旗權(quán)。
    3學(xué)習(xí)漢經(jīng)驗
    康熙帝學(xué)習(xí)并接受儒家經(jīng)典，研究中原歷朝統(tǒng)治經(jīng)驗，深悉預(yù)立儲君有利于皇權(quán)的連續(xù)性與穩(wěn)固性，是鞏固清王朝統(tǒng)治的頭等政治大事。他開始接受歷代皇位繼承的經(jīng)驗，特別是明王朝皇位嫡長制繼承皇位的歷史傳統(tǒng)。
    4平定叛亂所需
    當(dāng)時發(fā)生“三藩”之亂，偽托“朱三太子”反清復(fù)明，以之為號召聚眾起義，使康熙帝看到“太子”威力之大。他命殺掉吳三桂唯一的兒子、北京做質(zhì)的額駙吳應(yīng)熊，以喪其志，絕其望；同時，自己也立皇太子，以為身后預(yù)作準(zhǔn)備，并有壯大聲勢、穩(wěn)定心、加強皇權(quán)、鞏固統(tǒng)治的作用。
    5特殊原因
    皇太子胤礽的生母是皇后赫舍里氏，出身顯赫，她的爺爺索尼是輔政大臣、一等公，她的父親噶布喇是康熙的領(lǐng)侍衛(wèi)內(nèi)大臣，她的叔叔索額圖則官至大學(xué)士。赫舍里氏12歲嫁給玄燁，兩恩愛，但不幸生育胤礽時因難產(chǎn)而死，年僅22歲。康熙帝與這位早逝的皇后感情很深。舉個例子：康熙十三年（1674年）五月初五日，赫舍里氏去世后第三天，梓宮遷于紫禁城西，直到二十七日，康熙帝幾乎每天都去舉哀；后來他親自將梓宮送往昌平鞏華城，從六月到十二月，他去鞏華城34次，第二年又去了24次，第三年去了15次。有學(xué)者統(tǒng)計，從康熙十三年到十六年，他一共去了80次。這四年里，每逢臘月二十九，他都去鞏華城陪伴亡靈。母因子死，子以母貴。康熙帝對這位嫡子格外關(guān)愛，決定改變曾祖父、祖父、父親三代皇位繼承制度，而實行皇位嫡繼承制，預(yù)立胤礽為儲君。
    立儲失敗的原因
    作為一代圣主的康熙帝為什么處理不好儲位繼承的問題？
    1皇帝與儲君的矛盾
    一、沒有處理好皇帝與儲君的矛盾。當(dāng)時處于八和碩貝勒共治國政向中央集權(quán)過渡時期，預(yù)立儲君，包括皇帝、滿洲貴族和儲君本都一時無法適應(yīng)這種新的情況。比如，實行儲君制度，就應(yīng)當(dāng)堅持儲君不御政。皇太子御政，必然引發(fā)皇太子與皇帝的權(quán)力沖突。皇太子御政，必然從中植成黨羽，與皇權(quán)相爭。康熙帝一方面改革前代的皇位繼承制度，建立儲君；另一方面又讓太子領(lǐng)兵從政，派皇太子和其他皇子參與各種軍政事務(wù)，其本意是鍛煉和培養(yǎng)皇子，讓他們?yōu)閲医üαI(yè)。皇太子權(quán)勢的增長侵犯和威脅了皇權(quán)。無形中朝廷里似乎要出現(xiàn)兩個中心，至高無上的皇權(quán)受到侵犯。康熙帝事與愿違，陷入旋渦，遭到失敗。
    2太子與皇子的矛盾
    第二，沒有處理好太子與皇子的矛盾。明帝國諸王“列爵而不臨民、食祿而不治事”，清朝諸王“內(nèi)襄政本、外領(lǐng)師干”，這樣太子與皇子便發(fā)生矛盾。康熙帝本意是培養(yǎng)教育皇子，卻使他們增長了對權(quán)力與財富的**。這不依康熙帝的意志為轉(zhuǎn)移，也不是皇太子主觀意志所決定的。諸皇子成之后，賜封世爵，分撥口，建立府第，設(shè)置官署，對內(nèi)臨政，對外領(lǐng)兵。各自所屬員又“各庇護其主”，甚而糾集黨羽。這本身就容易與皇權(quán)產(chǎn)生某種矛盾。如果設(shè)立皇太子，其地位高于諸王，近于皇帝，又必然為諸皇子所不容，使矛盾更趨復(fù)雜。康熙帝兩立兩廢皇太子，既是皇帝與儲君矛盾，也是太子與皇子矛盾尖銳化的集中表現(xiàn)。
    軍事
    收復(fù)臺灣，開府設(shè)縣
    初步形成了剿撫并用的方針，即“亂則聲討，治則撫綏”（《清圣祖實錄》卷180，康熙36年2月壬寅），“仰憑天道，俯愜情，以萬不得已而用兵”（《御制親征平定朔漠方略序》）。康熙認為：“帝王治天下自有本原，不專恃險阻”，“守國之道惟修德安民，民心悅則邦本得，而邊境自固，所謂眾志成城者是也”（《清圣祖實錄》卷151，康熙三十年五月丙午）。為了維護祖國統(tǒng)一，康熙二十二年（1683年），康熙以施瑯為福建水師提督，收復(fù)了臺灣。康熙二十三年（1684年），清政府臺灣設(shè)一府（臺灣府）三縣，即臺灣縣（今臺南）、鳳山縣（今高雄）、諸羅縣（今嘉義），隸福建省，并臺灣設(shè)巡道一員，總兵官一員，副將二員，兵八千。澎湖設(shè)副將一員，兵二千。從而加強了中央對臺灣的管轄，促進了臺灣經(jīng)濟文化的發(fā)展。
    平定準(zhǔn)噶爾叛亂
    清初，西北方居住的蒙古分為漠南蒙古、漠北喀爾喀蒙古和漠西厄魯特蒙古三大部。漠北喀爾喀蒙古內(nèi)部又分為扎薩克圖、土謝圖、車臣等三部漠西厄魯特蒙古內(nèi)部又分為準(zhǔn)噶爾、和碩特、杜爾伯特、土爾扈特四部。清軍入關(guān)之前，漠南蒙古就已歸附大清，喀爾喀蒙古和厄魯特蒙古各部，也與清政府關(guān)系密切。
    噶爾丹起兵被粉碎以后，喀爾喀蒙古各部又回到了原來的居住地。清政府的幫助下，噶爾丹暫時退兵。
    玄燁設(shè)置將軍和參贊大臣率兵駐守科布多和烏蘇雅臺等重鎮(zhèn)，加強了對喀爾喀蒙古各部的管理和統(tǒng)治。
    謚號：合天弘運文武睿哲恭儉寬裕孝敬誠信功德大成仁皇帝，簡稱仁皇帝。詔令工部織染局歸內(nèi)務(wù)府。