一、陸軍航空兵編制
飛機3-4機為1小隊，9-12機為1中隊，2-4中隊為1大隊（12年后改稱聯(lián)隊）。
飛艇2-4艘為1中隊，2-4中隊為1大隊（12年后改稱聯(lián)隊）。
若干航空浮空大隊（聯(lián)隊）混編成航空集團，集中使用于某戰(zhàn)役方向。
亞俄戰(zhàn)爭時，配屬給各野戰(zhàn)軍或方面軍的航空浮空部隊稱“航空浮空群”或“集群”，由數(shù)量不等的中隊、大隊、集團混合編成。
戰(zhàn)斗機中隊通常為12機，偵察聯(lián)絡(luò)、轟炸、運輸機中隊通常為9機。
中隊由中隊部、飛行組和整備組構(gòu)成，戰(zhàn)斗機整備組通常編制70名。
聯(lián)隊部有直屬機，以4中隊的戰(zhàn)斗機聯(lián)隊為例，4個中隊編制48機，聯(lián)隊部直屬6機，合計54機。
4中隊的偵察轟炸聯(lián)隊通常編制1中隊偵察機和3中隊輕轟炸機，4個中隊編制36機，聯(lián)隊部直屬4機（偵察2輕轟2），合計40機（偵察11機、輕轟29機）。
4中隊的重轟炸聯(lián)隊，4個中隊編制36機，聯(lián)隊部直屬4機，合計40機。
陸軍航空部隊行政上直轄陸軍部航空廳，由陸軍航空總監(jiān)負責(zé)行政指導(dǎo)和監(jiān)理，戰(zhàn)時由各編成部隊指揮官指揮作戰(zhàn)。
陸軍航空總監(jiān)：王升平上將（飛機派）。
副監(jiān)兼陸軍副參謀長：郭志飛上將（飛艇派）。
珍珠港事件前，陸軍航空兵有100個航空中隊，約1100架作戰(zhàn)飛機。
其中：
偵察聯(lián)絡(luò)機中隊15個，編制135機。
戰(zhàn)斗機中隊30個，編制360機。
轟炸機中隊50個，編制450機（其中輕轟30個中隊270機，重轟20個中隊180機）。
運輸機中隊5個，編制45機。
另各聯(lián)隊部、航空集團司令部直屬150架各型機。
中隊番號說明：12年起統(tǒng)一編成三位數(shù)番號，其中：
偵察機為1字頭
戰(zhàn)斗機為2字頭
輕轟炸機為3字頭
重轟炸機為6字頭
聯(lián)絡(luò)運輸機為8字頭。
飛艇為9字頭。
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另有15個浮空中隊，42艘作戰(zhàn)飛艇。
其中，特務(wù)飛艇3個中隊，共6艘，編成第八特務(wù)聯(lián)隊，直轄大本營。
戰(zhàn)略攻擊飛艇6個中隊，共12艘，編成第一和第二特務(wù)聯(lián)隊，直轄大本營。
戰(zhàn)術(shù)攻擊飛艇6個中隊，共12艘（ftg3強云），編成第1和第2浮空聯(lián)隊。
偵察攻擊飛艇6個中隊，共12艘（ftg2紫云改造），編成第11和第12浮空聯(lián)隊。
戰(zhàn)前將90個航空中隊和12個浮空中隊編入四個航空集團，10個航空中隊和9個浮空中隊直轄大本營。
其中，大本營直轄部隊為
第1空運聯(lián)隊（第801-804空運中隊，40機）
第8戰(zhàn)斗機聯(lián)隊（第225-228中隊，54機）
獨立第252戰(zhàn)斗機中隊（12機）
獨立第810空運中隊（9機）
以上合計115機。
另有第1、2、8特務(wù)聯(lián)隊，合計6艘特務(wù)飛艇和12艘戰(zhàn)略攻擊飛艇。
四個航空集團編制如下：
*第一航空集團，預(yù)定用于西伯利亞方面（15年初一度用于菲律賓方面）。
司令官梁萬天中將（飛艇派）。
集團司令部直屬16機（偵察聯(lián)絡(luò)6，戰(zhàn)斗4，運輸6）
下轄：
第1戰(zhàn)斗機聯(lián)隊（第201-204中隊，54機）
第2戰(zhàn)斗機聯(lián)隊（第205-208中隊，54機）
第1偵轟聯(lián)隊（第101偵察中隊，第301-303輕轟中隊，共偵察11輕轟29機）
第3偵轟聯(lián)隊（第103偵察中隊，第307-309輕轟中隊，共偵察11輕轟29機）
第5偵轟聯(lián)隊（第105偵察中隊，第310-312輕轟中隊，共偵察11輕轟29機）
第51重轟聯(lián)隊（第801-804重轟中隊，40機）
第53重轟聯(lián)隊（第809-812重轟中隊，40機）
第56重轟聯(lián)隊（第817-820重轟中隊，40機）
獨立第251戰(zhàn)斗機中隊（12機）
獨立第151、153偵察聯(lián)絡(luò)中隊，共18機
以上35個中隊合計戰(zhàn)斗機124架，偵察聯(lián)絡(luò)機57架，輕轟87架，重轟120架，運輸機6架。
另有第1、2、11、12浮空聯(lián)隊，共12個中隊24艘飛艇。
*第二航空集團，預(yù)定用于中亞方面（15年初一度用于菲律賓方面和東印度群島方面）。
司令官方永楊中將（飛艇飛機騎墻派）
集團司令部直屬12機（偵察聯(lián)絡(luò)6，運輸6）
下轄：
第3戰(zhàn)斗機聯(lián)隊（第209-212中隊，54機）
第2偵轟聯(lián)隊（第102偵察中隊，第304-306輕轟中隊，共偵察11輕轟29機）
第6偵轟聯(lián)隊（第106偵察中隊，第313-315輕轟中隊，共偵察11輕轟29機）
獨立第155偵察聯(lián)絡(luò)中隊（9機）
以上13個中隊合計戰(zhàn)斗機54架，偵察聯(lián)絡(luò)機37架，輕轟58架，運輸機6架。
*第三航空集團，預(yù)定用于馬來亞方面（15年初一度用于法屬印度支那方面）。
司令官游緩中將（飛機派）
集團司令部直屬12機（偵察聯(lián)絡(luò)6，運輸6）
下轄：
第5戰(zhàn)斗機聯(lián)隊（第213-216中隊，54機）
第6戰(zhàn)斗機聯(lián)隊（第217-220中隊，54機）
第7偵轟聯(lián)隊（第107偵察中隊，第316-318輕轟中隊，偵察11輕轟29機）
第8偵轟聯(lián)隊（第108偵察中隊，第319-321輕轟中隊，偵察11輕轟29機）
第10偵轟聯(lián)隊（第110偵察中隊，第325-327輕轟中隊，偵察11輕轟29機）
第52重轟聯(lián)隊（第805-806重轟中隊，40機）
第55重轟聯(lián)隊（第813-816重轟中隊，40機）
獨立第152偵察聯(lián)絡(luò)中隊（合計9機）
以上29個中隊合計329機戰(zhàn)斗機108架、偵察聯(lián)絡(luò)機48架、輕轟炸機87架、重轟炸機80架、運輸機6架。
*第五航空集團，預(yù)定用于緬甸方面（15年初一度用于法屬印度支那方面）。
司令官馬恒明中將（飛機派）
集團司令部直屬10機（偵察聯(lián)絡(luò)4，運輸6）
下轄：
第7戰(zhàn)斗機聯(lián)隊（第221-224中隊，54機）
第9偵轟聯(lián)隊（第109偵察中隊，第322-324輕轟中隊，共偵察11輕轟29機）
第11偵轟聯(lián)隊（第111偵察中隊，第328-330輕轟中隊，共偵察11輕轟29機）
獨立第156偵察聯(lián)絡(luò)中隊（9機）
以上13個中隊合計戰(zhàn)斗機54架，偵察聯(lián)絡(luò)機35架、輕轟炸機58架、運輸機6架。
二、海軍航空兵編制
海軍航空兵的編制在1912年以前與陸航相近，1912年重整后自成一格。
單位編制方面，以2-3機編為小隊，6-18機編為中隊，若干同型或非同型中隊編為聯(lián)隊，其中艦載機中隊、聯(lián)隊與母艦共同編為（艦隊）航空戰(zhàn)隊，若干基地航空聯(lián)隊附若干獨立中隊編為（基地）航空戰(zhàn)隊，若干航空戰(zhàn)隊按戰(zhàn)役需要編為航空艦隊。
此外，中隊番號編列也與陸軍有所不同：
艦戰(zhàn)：1字頭
水偵：2字頭
艦偵：3字頭
艦攻：5字頭
陸攻：6字頭
陸偵：7字頭
飛艇：8字頭
水戰(zhàn)：9字頭
珍珠港事件前，海軍航空兵主戰(zhàn)兵力800余架飛機和24艘飛艇分屬三個航空艦隊和四個獨立航空戰(zhàn)隊，行政上由海軍部航空廳指導(dǎo)監(jiān)理，具體指揮交由聯(lián)合艦隊司令部。
三個航空艦隊編制如下：
*第一航空艦隊，
司令官梁書銘中將。
下轄：
第一航空戰(zhàn)隊，司令官畢凌波少將。
大鵬號配屬艦載第1聯(lián)隊，聯(lián)隊長蔡勇上校。
第501艦戰(zhàn)中隊（6機），首席王牌東方明中隊
第503艦戰(zhàn)中隊（6機）
第504艦戰(zhàn)中隊（6機），二號王牌蔡國蘭中隊
第115艦攻中隊（9機）
第116艦攻中隊（9機），祁鵬中隊
第117艦攻中隊（9機），祁冰、陸國平所在中隊
第118艦攻中隊（9機）
第119艦攻中隊（9機）
第301艦偵中隊（6機）
云鵬號配屬艦載第2聯(lián)隊，聯(lián)隊長司徒祺上校
第502、505、506艦戰(zhàn)中隊，各6機
第101、102、103、105、106艦攻中隊，各9機
第302艦偵中隊，6機
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第二航空戰(zhàn)隊，司令官東方高少將。
金隼號配屬艦載第3聯(lián)隊
第512、513艦戰(zhàn)中隊，各6機
第111、112、113、120艦攻中隊，各9機
第305艦偵中隊，6機
銀隼號配屬艦載第5聯(lián)隊
第515、516艦戰(zhàn)中隊，各6機
第107、108、109、110艦攻中隊，各9機
第303艦偵中隊，6機
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以上兩個航空戰(zhàn)隊共編制32個中隊合計246機，其中：艦戰(zhàn)10個中隊60架，艦攻18個中隊162架，艦偵4個中隊24架。
一航艦直屬預(yù)備隊（輪換上艦并作為新艦載聯(lián)隊編成基礎(chǔ)）：
第507、509、510、511、512艦戰(zhàn)中隊
第121、122、123、125、126、127、130艦攻中隊
第306艦偵中隊
共12個中隊90機，其中艦戰(zhàn)5個中隊30架，艦攻6個中隊54架，艦偵1個中隊6架。
*第三航空艦隊，
司令官凌翼少將
直屬水偵6，陸偵6。
下轄：
第七航空戰(zhàn)隊
戰(zhàn)隊直屬6架陸偵
陸基101聯(lián)隊
轄第651-656陸攻中隊，各9機，合計54機。
陸基102聯(lián)隊
轄第657-662陸攻中隊，各9機，合計54機。
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第八航空戰(zhàn)隊
戰(zhàn)隊直屬2架水偵
第1水機混成聯(lián)隊，轄第211-213水偵中隊，共18機。
第1海軍浮空聯(lián)隊，轄12艘ftg2紫云改裝的巡邏飛艇
第2海軍浮空聯(lián)隊，轄12艘ftg3強云改裝的巡邏飛艇
獨立第221水偵中隊，6機。
獨立第901、902水戰(zhàn)中隊，共12機
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以上兩個戰(zhàn)隊合計108架陸攻，32架水偵、12架水戰(zhàn)、12架陸偵和24艘飛艇。
*第五航空艦隊（基地航空部隊，配屬東海方面艦隊）
珍珠港事件前
下轄的第9航空戰(zhàn)隊擁有50架各式飛機，分散部署在東海方面各前線島嶼。
第10航空戰(zhàn)隊即檀香山航空隊，此時編制約100機，夏威夷群島平定后立即進駐。
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4個獨立航空戰(zhàn)隊包括：
*第三航空戰(zhàn)隊，28機，編入主力部隊
海鷹配屬第201水偵中隊，14機
獵鷹配屬第202水偵中隊，14機
*第四航空戰(zhàn)隊，28機，編入主力部隊
神鷹配屬第203水偵中隊，14機
金鷹配屬第205水偵中隊，14機
*第五航空戰(zhàn)隊，12機，編入東海方面艦隊
飛鷹配屬第207水偵中隊，6機
天鷹配屬第206水偵中隊，6機
*第六航空戰(zhàn)隊，即配屬東南方面艦隊的拉包爾航空隊，珍珠港事件前兵力較薄弱，僅直轄3架陸偵、9架陸攻，以及3個水機中隊：
獨立第223、225水偵中隊，共12機
獨立第903水戰(zhàn)中隊，6機
合計30架飛機。
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此外，部分巡洋艦以上水面艦只共搭載有以單機或小隊為單位的水偵50架以上。
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