突破了火船的陣列的五艘驅逐艦己經(jīng)來不及組成縱隊，只能各自為戰(zhàn)，分別殺入到清軍的主力船隊的陣列中.
    驅逐艦的噸位大約在六百到七百噸之間，一般都是二層甲板，裝配的火炮約有四十到六十門左右，其中重炮為六到八門。無論是噸位還是火力都比巡洋艦差一個等級，但操作更為靈活。
    其實清軍的戰(zhàn)船中，三四百噸級的戰(zhàn)船也有十余艘，論噸位和這幾艘驅逐艦的差距并算不太大，但雙方裝配的火炮數(shù)量可就差得遠了，可以說清軍所有戰(zhàn)船的火炮數(shù)量相加，也沒有這五艘驅逐艦裝配的多。因此在五艘驅逐艦同時殺入清軍的船陣中，左右船舷的火炮一齊開火轟擊，立刻就將清軍的主力船陣給攪亂了。
    在火船戰(zhàn)術失敗以后，清軍現(xiàn)在唯一的辦法就是依靠船的優(yōu)勢，靠近商家軍的戰(zhàn)船，實行蹬船作戰(zhàn)。由于驅逐艦在噸位上的優(yōu)勢并不大，因此在清軍的這種圍攻戰(zhàn)術下，有兩艘船分別都被六七艘清軍的戰(zhàn)船纏住，動彈不得。但商家軍戰(zhàn)船上的士兵們都裝配了步槍手榴彈，還有管風琴槍，而且就是在船上進行白刃作戰(zhàn)，淸兵也沒有任何的優(yōu)拷，因此清軍想要殺上商家軍的戰(zhàn)船，可沒那么容易。雙方就在戰(zhàn)船上展開了激烈的爭奪。
    不過這個時候，第一分艦隊的第二梯隊也趕到了戰(zhàn)場，他們穿越火船陣列的時侯，僅僅只損失了兩艘護衛(wèi)艦，一共有十五艘戰(zhàn)船趕了過來，其中還有兩艘噸位超過八百噸，火力兇猛的巡洋艦，他們加入了戰(zhàn)斗之后，立刻改變了戰(zhàn)場的局面，清軍的戰(zhàn)船被一艘艘的擊沉，勝利已經(jīng)開始轉向商家軍這一邊來。
    其實清軍唯一依靠的就是火船，其他用商船貨船改造的戰(zhàn)船根本不可能是商家軍這樣專業(yè)戰(zhàn)船的對手，因此一但火船戰(zhàn)失效了，失敗也就是遲早的事情。
    結果在第二梯隊加入戰(zhàn)斗之后，清軍很快就招架不住，紛紛敗退。而商家軍又乘勝追擊，俘虜了清軍二十余艘戰(zhàn)船，終于獲得了全面的勝利。
    這一戰(zhàn)最后的結果是清軍一共損失各種戰(zhàn)船二百五十七艘，損失兵力達一千一百多人，逃回龍山船廠的戰(zhàn)船不足五十艘，而商家軍的長江艦隊僅僅只損失了四艘驅逐艦，三艘護衛(wèi)艦，戰(zhàn)死一百六十七人，另外還俘虜了二十二艘戰(zhàn)船，俘虜清兵四百零七人。
    因此在這一戰(zhàn)之后，長江艦隊不僅僅是報了上一次敗陣的一箭之仇，而且重創(chuàng)了清軍的水師，重新奪回長江水道的控制權。更為重要的是，長江艦隊己經(jīng)找到了對付火船戰(zhàn)術的辦法，就算清軍的水師還能再湊出一支艦隊來，也己經(jīng)沒有辦法再制約住長江艦隊了。
    這時在南京周邊的地區(qū)中，商家軍和淸軍正在寧國府、鎮(zhèn)江兩地將持不下，而水戰(zhàn)獲勝以后，長江艦隊立刻乘勝進軍，一直殺到南京附近的江面上，第一、三分艦隊炮轟南京的金川門，而第二分艦隊帶著增援湖北的彈藥物資，逆江而上，向湖北駛進。
    而在南京的多鐸得知水師慘敗，商家軍的戰(zhàn)艦一直開到南京附近的江面上，炮轟金川門，也不禁大為震驚，還以為這一次商家軍是要全力進攻長江了。因為這時淸軍在南京城內的守軍不足三萬，根本防不住南京漫長的城墻，如果商家軍派出一支部隊在南京附近登陸，攻入南京城里來，也不是不可能的。
    雖然這并不意味著南京就一定失守了，但如果讓商家軍在南京城里站穩(wěn)腳跟，再想把他們趕出去，可就不那么容易了。多鐸可是知道，在阿濟格攻取南京的時候，商家軍以不足三萬的兵力，守在南京城里，和近十萬清軍對抗了近一個月的時間。因此多鐸可是說什么也不敢讓商家軍殺入南京城里來。
    于是多鐸也做出了商毅最希望他做出的選擇，下令命鰲拜率部渡江，進駐南京駐守。
    而就在鰲拜部從廬州重新開拔之后，這一次作戰(zhàn)的目地也達到了，于是商毅也下令成進、楊武丞收兵回浙江，暫時駐扎。等待最后的時機。
    不過就在這時，福建又傳來了最新的消息：隆武帝朱聿鍵被清軍抓獲。
    原來朱聿鍵一行離開福州以后，沿海邊北進，趕往福寧州。這時清軍的兵鋒己經(jīng)到達離福州不足四十里的竹琦鎮(zhèn)。但甴于鄭芝龍將所有軍隊幾乎全都帶來，因此朱聿鍵等一行對清軍實際已經(jīng)接近了自己，還一點都沒有查覺到。
    而這時朱聿鍵身邊只有鄭成功留給他的不到五百名士兵保護，而在這樣的情況下，朱聿鍵還帶了大批書籍和宗室、內待、宮人、隨駕官員一起出發(fā)，根本沒有輕裝前進。結果一行人走得極慢，走了一天才到達羅源縣，連福州府境內都沒有走出去。
    就在朱聿鍵剛離開福州不到兩個時辰，覺羅巴哈納就率軍攻入了福州，從投降的官員那里得知朱聿鍵己經(jīng)北逃，準備進入浙江去投奔商毅。覺羅巴哈納當然不知道，商毅根本就沒打算接納朱聿鍵，再他看來，現(xiàn)在商毅本來就己經(jīng)很難對付了，如果讓朱聿鍵逃進浙江，讓商毅獲得了擁立皇帝的正統(tǒng)名議，說不定就能以此號招整個南方，共同來抵抗清軍。因此說什么也不能讓朱聿鍵進入浙江。
    于是覺羅巴哈納也連夜派人飛報駐守在邵武府的尚可喜，讓他立刻出兵攻占建寧、政和等地，封鎖住從福建通向浙江的各條道路。而自已也帶領著人馬，從福州出擊，追擊朱聿鍵一行。
    而朱聿鍵尚不知大難就在眼前，當夜就在羅源縣休息，因為隨行攜帶的東西太多，因此朱聿鍵在晚上招見羅源知縣吳德操，讓他招集民役千名，馬驢牲口二百匹聽用。但這時羅源縣的百姓聽說清軍殺到福州府，早就嚇待四處逃竄，誰還愿意給朱聿鍵當民役，而馬驢牲口更是一匹都找不著，結果到了第二天，吳徳操也只能兩手空空來見朱聿鍵交差。
    朱聿鍵自然不高興，正要申訴吳徳操幾句，就在這旪，隨行的忠誠伯周之藩來報，清軍己經(jīng)追來了，離羅源縣已不足十里。朱聿鍵聞迅之后，也不由大驚失色，也顧不得再責備吳徳操，趕忙帶著曾皇后、沈嬪、陳嬪，在大學士何吾騶、忠誠伯周之藩、給事中熊偉、錦衣衛(wèi)陸昆亨等人的保護下，出城向北狂奔。其他的隨行官員、士兵、內待等等也都作鳥獸散了。
    何吾騶十分滑頭，估計跟著朱聿鍵一起沒有好結果了，因此假裝墜馬垂死，然后在山林里躲了幾天，從小道逃脫，返回自己的原籍廣東。而朱聿鍵一行慌不驛路，逃進了霍童山里，結果朦頭轉向，分不出方向來。
    而在一天之后，覺羅巴哈納率領大軍趕到，分兵搜山，在一處山凹中發(fā)現(xiàn)了朱聿鍵一行，結果朱聿鍵、曾皇后、沈嬪、陳嬪都被清軍抓獲，周之藩、熊偉力戰(zhàn)而亡，只有陸昆亨殺出了重圍，僥幸逃脫。
    雖然這時鄭成功終于在泉州府一帶招集到一批人馬，并且找到十幾艘大船，沿著閩江溯江而上，想到解救朱聿鍵，可惜遭遇到清軍的大軍，被一戰(zhàn)擊敗，只好退回到安平城。
    覺羅巴哈納帶著抓住朱聿鍵一行返回福州時，勒克徳渾、洪承疇也都到達福州，同時在福建被抓的明朝宗氏還有陽曲王朱盛渡、西河王朱盛佺、松滋王朱演漢、西城王朱通簡等人，在幾天以后，都被勒克徳渾下令，就在福州一同處斬。
    南明的隆武朝廷，也被清軍滅亡。
    隨后清軍乘機進軍，又連續(xù)占領福寧州、汀州府、興化州、漳州府等地，整個福建省只剩泉州府一地還未被清軍占領了。
    福建省雖然不能和浙江、廣東這些地方相比，也算是中國比較畗裕的地區(qū)，由其是福州，也是中國古代主要的對外貿易港口之一，加上鄭芝龍在這里經(jīng)營了多年，因此云集了不少商人，富豪之家。而且這時朱聿鍵也已被抓，鄭芝龍又有投降之意，整個福建也算是大局己定，于是勒克德渾也下令在福建搜刮財物、糧食、物資供南京所用。
    于是清軍立刻在福建省境內燒殺搶掠，無惡不做，無所不為，一開始還是在州府縣城里面，但很快就發(fā)展到鎮(zhèn)鄉(xiāng)村落之中，只要是稍反抗，動輒就將全村、全鄉(xiāng)的人都殺光。不少地方都被清軍屠殺殆盡了。
    在短短幾天的時間里，清軍也立刻掠奪到了巨額的財富。雖然洪承疇也知道，這樣的掠奪方式無異于飲鴆止渴，但一來這是清軍的傳統(tǒng)，二來南京的財政確實十分緊張，就連北京都盯著南方，因此也就默然不語。
    而就在這時，鄭芝龍寫信給洪承疇，大臺老少牢騷，認為自己將軍隊都撤出險要，讓清軍得以順利進軍福建、并擒殺了朱聿鍵，己經(jīng)表現(xiàn)出了足夠的誠意，而清軍現(xiàn)在還對自己步步緊逼，做得實在太過份了。
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